什么是组氨酸结构?

组氨酸(Histidine, 缩写为His或H)是蛋白质的20种标准氨基酸之一,其结构由一个核心的α-碳原子组成。
这个α-碳原子连接着四个不同的基团:

  • 一个α-氨基(-NH2
  • 一个α-羧基(-COOH)
  • 一个氢原子(-H)
  • 一个独特的侧链(R基)

正是这个侧链赋予了组氨酸与其他氨基酸截然不同的结构和化学性质。组氨酸的α-碳原子是手性的(甘氨酸除外),这意味着它存在两种镜像异构体,即L型和D型,在生物体内发现的主要是L型组氨酸。

组氨酸侧链结构具体是什么样的?

组氨酸最显著的结构特征在于其侧链。这个侧链是一个相对复杂的环状结构,被称为咪唑环(Imidazole ring)。

咪唑环是一个五元杂环,包含两个氮原子和三个碳原子。组氨酸的侧链通过一个亚甲基(-CH2-)基团连接到α-碳原子上。所以,完整的组氨酸侧链结构是:

α-碳原子 – CH2 – 咪唑环

咪唑环本身的结构包含两个氮原子:一个氮原子与一个双键相连(类似于吡啶环中的氮),另一个氮原子则与两个单键相连并带有一个氢原子(类似于吡咯环中的氮)。这两个氮原子在环中分别处于1位和3位(或称为π-氮和τ-氮,取决于编号方式)。

为什么组氨酸的侧链结构如此特别?

组氨酸侧链的咪唑环结构之所以特别,主要在于它包含的两个氮原子以及由此产生的共振结构特性。

两个氮原子与电离

咪唑环中的两个氮原子具有不同的化学环境和碱性。与双键相连的氮原子上含有一个未共享的电子对,这个电子对可以接受一个质子(H+),使得咪唑环在合适的pH条件下可以发生质子化(带正电)。
带有氢原子的另一个氮原子,其孤对电子参与了环的芳香性(π电子系统),因此碱性较弱,通常不直接接受质子,但可以在质子化后通过共振稳定正电荷。

共振稳定性

当咪唑环质子化后,增加的质子可以与环中的任一个氮原子连接(尽管更倾向于连接到原来与双键相连的那个氮上)。质子化后的咪唑环的正电荷可以在两个氮原子之间通过共振进行分散。这种共振结构使得质子化后的咪唑环更加稳定,也解释了为什么它的pKa值位于接近中性的范围(约6.0)。

组氨酸结构有多少个可电离基团?各自在哪里?

一个游离的(未结合在蛋白质中的)组氨酸分子结构中通常包含三个可电离的基团:

  1. α-羧基:位于α-碳原子上。在酸性条件下带电荷(-COOH),在高pH条件下失去质子带负电荷(-COO)。
  2. α-氨基:位于α-碳原子上。在酸性条件下接受质子带正电荷(-NH3+),在高pH条件下失去质子呈电中性(-NH2)。
  3. 咪唑侧链:位于通过亚甲基连接到α-碳原子上的咪唑环。在酸性或接近中性的条件下可以接受一个质子带正电荷(咪唑鎓离子),在高pH条件下失去质子呈电中性(咪唑)。质子化通常发生在环中与双键相连的氮原子上。

组氨酸结构不同电离状态下的电荷是多少?

由于拥有三个可电离基团,组氨酸的电离状态会随pH值的变化而变化,其总净电荷也随之改变。

极低pH条件(强酸性)

在非常低的pH下,所有三个可电离基团都处于质子化状态:

  • α-羧基:-COOH (电中性)
  • α-氨基:-NH3+ (带 +1 电荷)
  • 咪唑侧链:质子化咪唑环 (带 +1 电荷)

此时,组氨酸的总净电荷为 +2

中等pH条件(接近其侧链pKa,约pH 6)

随着pH升高,首先是酸性最强的α-羧基失去质子:

  • α-羧基:-COO (带 -1 电荷)
  • α-氨基:-NH3+ (带 +1 电荷)
  • 咪唑侧链:质子化咪唑环 (带 +1 电荷)

此时,总净电荷为 +1。随着pH进一步升高并接近咪唑侧链的pKa(约6.0),咪唑环开始失去质子:

  • α-羧基:-COO (带 -1 电荷)
  • α-氨基:-NH3+ (带 +1 电荷)
  • 咪唑侧链:去质子化咪唑环 (电中性)

当α-氨基和咪唑侧链的质子化程度达到某种平衡时(特别是当总净电荷为零时),分子处于两性离子状态。理论上,等电点(pI)在咪唑侧链pKa和α-氨基pKa之间,但侧链的电离是关键,所以pI更接近中性。当咪唑完全去质子化后,总净电荷为 0

高pH条件(碱性)

在更高的pH下,碱性较强的α-氨基失去质子:

  • α-羧基:-COO (带 -1 电荷)
  • α-氨基:-NH2 (电中性)
  • 咪唑侧链:去质子化咪唑环 (电中性)

此时,组氨酸的总净电荷为 -1

总结不同pH下的主要电离状态:

极低 pH (+2) → 低 pH (+1) → 中性 pH (0) → 高 pH (-1)

其中,咪唑侧链的电离过程(从+1到0)发生在接近生理pH的范围(pKa约为6.0),这使得组氨酸成为一个重要的生物缓冲剂。

组氨酸结构的pKa值大约是多少?

游离组氨酸的三个可电离基团各自具有其特征性的酸度常数pKa值。这些值会因环境(例如在蛋白质内部)而略有变化,但典型值如下:

  • α-羧基 (pKa1): 约 2.3
  • 咪唑侧链 (pKaR): 约 6.0
  • α-氨基 (pKa2): 约 9.7

其中,咪唑侧链的pKa值约6.0,这一数值非常接近许多生物环境的生理pH(约7.4)。这意味着在生理条件下,咪唑环可以在质子化(带正电)和去质子化(电中性)两种状态之间快速转换,从而能够吸收或释放质子,发挥重要的缓冲作用。这是组氨酸结构在生物功能中尤为关键的一个性质。

组氨酸的侧链结构有多少个碳原子和氮原子?

组氨酸的侧链结构由以下原子构成:

  • 一个亚甲基(-CH2-)基团,包含1个碳原子和2个氢原子。
  • 一个咪唑环,包含3个碳原子(不包括与亚甲基相连的那个碳原子本身,但咪唑环骨架上的3个碳)和2个氮原子

因此,组氨酸的整个侧链(R基团)总共包含 4个碳原子 (1个在亚甲基,3个在环上) 和 2个氮原子 (都在咪唑环上),以及相应的氢原子。

组氨酸的结构是如何在肽链中存在的?

当组氨酸参与构成蛋白质肽链时,其α-氨基α-羧基会与其他氨基酸形成肽键(-CO-NH-)。这意味着这些基团的大部分特性被结合在主链结构中,不再像游离氨基酸那样自由电离。

然而,组氨酸的咪唑侧链(R基)是连接在肽链主链上的,它保留了其独特的结构和化学性质,特别是其在接近中性pH下的电离能力。

因此,在蛋白质内部或表面,组氨酸残基的咪唑环是主要的电离和反应活性部位之一。它的电离状态仍然取决于局部微环境的pH以及蛋白质中周围氨基酸残基的影响。咪唑环的平面结构和两个氮原子的性质使其能够参与氢键、π-π相互作用,以及作为酸或碱催化反应,这都源于其特定的侧链结构。


组氨酸结构

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